5月22日上午，人们还沉浸在对四川汶川大地震中遇难同胞的哀悼中，承载着我国大洋考察第20航次任务的“大洋一号”船首批66名船队员，又满怀着 “与祖国同命运，为人类探大洋”的豪情踏上了探索大洋的新征程。
起航仪式在广州长洲——中国海监第八支队码头举行。中国大洋协会理事长、国家海洋局副局长王飞，外交部条法司徐宏副司长，广州市人民政府陈明德副市长，海军广州基地吴仿春司令员和财政部、中国地质调查局等相关部门的领导为船队员们送行。
大洋科考第20航次计划时间250天，航程约3.4万海里，分为6个航段实施，预计2009年1月26日返回青岛。本航次调查区域涉及西太平洋、东太平洋、西南太平洋和西南印度洋。主要目标是在大洋科考第19航次的基础上，重点对西南印度洋中脊我国首次发现的活动热液喷口区开展多学科的综合性调查，了解热液区的地质、地球物理特征及海底热液硫化物的分布，并在喷口区周边寻找新的热液异常；同时开展洋中脊区域的环境和生物多样性研究，重点调查超慢速扩张脊微生物多样性及生物地理分布；在东太平洋海隆进行调查并验证热液异常，力争发现新的热液活动区。
本航次由国家海洋局第二海洋研究所具体组织实施。共有来自国内外24家科研、教育院所的145名科技人员参加。除了参加单位和人数多、范围广之外，它的另一个显著特点是技术手段高，将采用许多自主研发的高技术新设备。如3500米的深海观测和取样型无人遥控潜水器（ROV）、近底声学和光学深拖探测系统、生物取样器、可视箱式取样器、浅底层岩芯钻、电视抓斗以及深海观测锚系系统等，其中自主设计的ROV和深拖系统是第一次使用。
起航仪式上，甄松刚船长还将凝聚着66名船队员对灾区人民牵挂和爱心的3.36万元捐款交给了中国大洋协会办公室党委书记张利民转交灾区。
