2013年10月14日，水利部办公厅会同国家档案局经科司组成档案专项验收组，对国务院第一次全国水利普查领导小组办公室产生的水利普查档案进行了专项验收。验收组认为其普查档案收集齐全，分类科学，整理规范，满足了完整、准确、系统与安全性的要求，并建立了全部档案的案卷级和文件级数据库，为今后水利普查档案的利用创造了很好条件，一致同意国务院第一次全国水利普查领导小组办公室的水利普查档案通过专项验收。

    自国务院启动第一次全国水利普查以来，水利部和国家档案局及国务院第一次全国水利普查领导小组办公室高度重视普查档案管理工作。由于制度先行,提早布置，要求明确，管理规范，组织实施到位，各级水利普查机构也已圆满完成了普查档案工作，完整地保存了第一次全国水利普查所获得的技术、经验和数据等成果。此次水利普查档案顺利通过验收，是第一次全国水利普查圆满收尾的重要标志之一，也为普查项目验收奠定了基础。